1.准确诊断
找出病因选择敏感高效的药物。临床上支原体病、大肠杆菌病、新城疫、传染性支气管炎等一系列的细菌病、病毒病都可以引起呼吸系统疾病。标本兼治，注意控制病原，并配合一定的解表药物，才能获得较好疗效。当畜禽患急性支气管炎时，若病畜咳同时带有大量浆液性鼻液，并伴有发热等全身症状时，则是急性呼吸道感染，应以抗菌药物控制感染为主，同时选用刺激性较弱，促进分泌的祛痰药如氯化铵以及中药桔梗、远志等进行治疗。祛痰药一般在饲前空’腹服用效果显著。当痰的黏度增高，难以咳出时，应选溶痰药或恶心性祛痰药，如氯化铵、桔梗、远志、碘化钾、愈创木酚甘油醚，以及其他刺激性祛痰药，如松节油、桉叶油等，后两药宜蒸汽吸入或相互配合进行治疗。
2.注意给药种类、途径、剂量和疗程
由于呼吸道疾病一旦表现较为明显时，就很难控制，尤其是禽类，病菌分布在气囊部位，因气囊部位的血管较少，使得许多抗菌药较难达到该部位，而不能很好的控制疾病，因此、治疗呼吸道病要选择合理的给药途径，用药时最好是饮水和喷雾给药相结合，可达到更好的疗效，用药时一定要有足够的疗程。
3.药物的合理配伍
根据药物的结构合理选用对病菌敏感的药物，作用位点相同的药物联合使用会产生拮抗作用，例如治疗大肠杆菌不能选用同样作用于50S亚基的药物，酰胺醇类的氟苯尼考和大环内酯类如泰乐菌素等、其他类的泰妙菌素、林可胺类如林可霉素联合用药。作用位点不同的如四环素类作用于30S亚基和酰胺醇类药物氟苯尼考，其他类的泰妙菌素、沃妮妙林作用于50S亚基，联合用药则产生协同作用。根据药物的作用机制，静止期杀菌药，氨基糖苷类如丁胺卡那霉素与快速抑菌药四环素类如多西环素、大环内酯类如泰乐菌素、林可胺类如林可霉素。
4.临床疗效评价指标
许多厂家根据养殖户所认为的疗效标准——用药后咳嗽不明显，就认为有疗效，结果产品中加人大量的西药镇咳药，使得痰液不能较好的排出体外，虽然表面上不表现临床症状了，但由于没有消除发病的根本原因，反而会造成较大的损失。
